Módulos PhenomeOne

  • Sistema principal
  • PhenoTop
  • Gestión de Inventario
  • Análisis
  • Genomics
  • PhenomeBI

Sistema Principal

El sistema principal de PhenomeOne está diseñado para administrar toda la información de investigación de plantas de la organización. PhenomeOne es la plataforma perfecta para la colaboración entre usuarios, lo que la convierte en su sistema organizativo principal para todos los datos de investigación, los cuales se pueden actualizar en carpetas compartidas en un árbol de directorio corporativo dedicado, dentro del sistema. El sistema cubre todos los procedimientos, comenzando desde el pre-mejoramiento, mejoramiento y pruebas de variedades, donde cada grupo tiene su propio espacio de trabajo. Por ejemplo, en este módulo los Criadores administran sus materiales genéticos, realizan un seguimiento del desarrollo de pedigríes, diseñan, planifican y ejecutan ensayos, aplican diseños de campo manuales o automatizados, administran observaciones, crean nuevos materiales genéticos utilizando cualquier método de propagación y producen etiquetas con códigos de barras, informes y más. 

PhenoTop

PhenoTop es la nueva aplicación móvil de PhenomeOne para teléfonos inteligentes y tabletas (compatible con dispositivos iOS y Android). Está diseñado para la recopilación en campos de datos online y offline, tales como observaciones y selecciones, incluidas imágenes.

Los campos se diseñan en el sistema principal y luego se comparten con la información relevante en el dispositivo móvil. Por lo tanto, los datos se pueden recopilar offline y online y sincronizarse de manera automática y constante cuando se conecta a Internet. El estado de sincronización se muestra para cada campo.

PhenoTop muestra una lista de campos compartidos con los dispositivos móviles de los usuarios, incluida la información de parcelas y plantas. La pantalla «Perfil de parcela» muestra el Germoplasma plantado en cada parcela e información de apoyo, como galería de fotos, observaciones, selecciones y plantas. 

Gestión de Inventario

Este módulo implementa flujos de trabajo que integran actividades de inventario de rastreo y seguimiento de lotes de germoplasma a lo largo del ciclo de vida del producto durante las fases de investigación. Por lo tanto, la gestión del inventario se convierte en parte de la siembra, la cosecha, el registro de las semillas y plantas cosechadas, la actualización de las cantidades, utilizando códigos de barras o códigos QR, pesas electrónicas y refractómetros.

El germoplasma en PhenomeOne se refiere a cada material genético único, mientras que el lote de germoplasma se refiere a la entidad física de la genética, generalmente semillas o plantas. El mismo germoplasma (entidad genética) puede tener varios lotes (paquetes de semillas físicas) y cada lote se puede almacenar en cada ubicación.

Análisis

El módulo Analytics aplica herramientas estadísticas y algorítmicas tales como análisis personalizados, gráficos curvilíneos, significancia estadística, para traducir los datos fenotípicos y genotípicos generados a decisiones inteligentes.

La plataforma integra varios kits de medición y visualización para consultar y analizar datos durante las fases de investigación. El módulo de Análisis presenta distribuciones de rasgos cuantitativos y cualitativos, análisis multivariante, agrupamiento, mapas de calor, superposiciones de pedigrí con múltiples fenotipos (o marcadores), capacidad de combinación, genotipo por el entorno, heredabilidad idiosincrásica, pruebas estadísticas (prueba T, prueba F, análisis de varianza), correlaciones y más.

Genomics

Cargue su análisis de GWAS y QTL en el módulo Genomics de PhenomeOne para identificar los marcadores genéticos que afectan a los rasgos que busca.

RESUMEN DEL MÓDULO GENOMICS:

  • Ejecuta análisis QTL o GWAS utilizando múltiples métodos estadísticos en minutos, con unos pocos clics del mouse.
  • Encuentra marcadores de ADN que afectan a sus fenotipos

PhenomeBI

El módulo PhenomeBI implementa un algoritmo único e innovador para predecir el rendimiento de los híbridos. Como resultado, este módulo puede aumentar las posibilidades del criador para identificar la combinación de padres con alto potencial para crear un híbrido exitoso.
La predicción del sistema para que las líneas parentales se crucen se obtiene mediante el análisis de todos los datos existentes, incluido el rendimiento de los padres y las generaciones anteriores, híbridos anteriores, puntuaciones de fenotipos, resultados de resistencia a enfermedades, etc.

El usuario define un perfil de rasgos que surge de los rasgos deseados para los híbridos por cada programa de cría y permite que el sistema escanee y busque en la base de datos las mejores combinaciones de padres que coincidan con ese perfil.